Line sigue haciendo esfuerzos para convertirse en una de las aplicaciones de mensajería instantánea más seguras. Su último paso en esta carrera de fondo ha sido la introducción del cifrado de punto a punto (E2EE) para proteger con mayor eficacia las ubicaciones de los usuarios y las conversaciones entre ellos, aunque poco a poco se irá ampliando para reforzar la seguridad también en otros aspectos.